More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2470 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
345 aa  691    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  89.86 
 
 
345 aa  633  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2865  glycosyl transferase group 1  74.71 
 
 
347 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  60.47 
 
 
346 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37.56 
 
 
376 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.32 
 
 
388 aa  99.8  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  36.1 
 
 
370 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
457 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
748 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  30.99 
 
 
371 aa  93.6  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
357 aa  92  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
393 aa  92.4  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
452 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  31.46 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
421 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  27.12 
 
 
404 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
398 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
417 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
358 aa  87.4  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
360 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 
364 aa  86.7  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
407 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
405 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.4 
 
 
390 aa  86.3  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  35.45 
 
 
377 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 
462 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  23.31 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0432  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.98 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  21.71 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  41.12 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
440 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  33.06 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
409 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  32 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4001  glycogen synthase  29.15 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4075  glycogen synthase  29.15 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  29.73 
 
 
382 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
355 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
413 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  24.84 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
418 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
390 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
411 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4220  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4245  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
414 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.395564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.19 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.28 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 
419 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  34.51 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  34.51 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  34.51 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
377 aa  79.3  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.51 
 
 
381 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  28.3 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
409 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  28.01 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>