More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3892 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 408 aa  825    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  84.12 
 
 		 405 aa  701    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  66.34 
 
 		 402 aa  529  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  42.68 
 
 		 407 aa  311  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 		 446 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  30.97 
 
 		 385 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 376 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  38 
 
 		 383 aa  97.1  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 		 458 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.22 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 377 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.05 
 
 		 365 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.72 
 
 		 360 aa  93.2  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  30.13 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  29.27 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 		 394 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 467 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 		 390 aa  89.7  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 		 367 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  26.3 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 344 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 398 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 381 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.5 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.86 
 
 		 935 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 346 aa  86.3  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 383 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 748 aa  86.3  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.41 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 		 770 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 402 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.15 
 
 		 536 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.79 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.29 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  36.3 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1499  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.415023  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  33.12 
 
 		 440 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  28.57 
 
 		 395 aa  82.8  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0447  glycosyl transferase, group 1  41.41 
 
 		 381 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.429575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.48 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  35.48 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.29 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>