More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1051 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  83.64 
 
 		 455 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 445 aa  875    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  38.54 
 
 		 398 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  38.34 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  34.5 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  34.38 
 
 		 386 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  35.79 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  33.87 
 
 		 384 aa  179  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 		 518 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 		 361 aa  162  9e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 		 499 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 387 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 		 605 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 565 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  31.68 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 388 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  32.2 
 
 		 425 aa  132  9e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  32.74 
 
 		 440 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 468 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 349 aa  98.6  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  34.88 
 
 		 448 aa  97.8  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 		 434 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 		 420 aa  97.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 382 aa  96.3  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  32.9 
 
 		 450 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36.1 
 
 		 406 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  30.21 
 
 		 650 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  33.46 
 
 		 466 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  32.05 
 
 		 443 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 360 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1916  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 378 aa  91.3  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 		 448 aa  90.9  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 366 aa  90.5  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 482 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 383 aa  89.7  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 435 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  31.47 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 373 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  33.48 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 385 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 397 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  33.2 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.94 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  28.21 
 
 		 428 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 		 384 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 366 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.48 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  27.54 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  33.89 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 770 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  32.9 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  35.96 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.83 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 		 672 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.74 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>