More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3857 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
423 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  73.71 
 
 
422 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  49.6 
 
 
374 aa  329  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  49.47 
 
 
388 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
373 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  47.31 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  50.28 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  51.34 
 
 
374 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  47.54 
 
 
374 aa  296  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  45.43 
 
 
390 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  46.83 
 
 
376 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  45.99 
 
 
374 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  46.17 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  48.51 
 
 
370 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 
375 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 
375 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  46.15 
 
 
375 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  43.85 
 
 
374 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  46.22 
 
 
376 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  46.77 
 
 
377 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  44.36 
 
 
385 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  43.98 
 
 
384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  48.67 
 
 
398 aa  251  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  43.47 
 
 
376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  43.92 
 
 
382 aa  243  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  44.44 
 
 
378 aa  239  5e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  44.62 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  40.37 
 
 
377 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  40.45 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
386 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
381 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.12 
 
 
383 aa  125  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
770 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  30.73 
 
 
770 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  27.44 
 
 
382 aa  117  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
360 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
373 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  36.6 
 
 
395 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
389 aa  107  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
370 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
378 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1737  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
395 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3818  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
397 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.406425 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
419 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
364 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.76 
 
 
383 aa  102  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
408 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
414 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
389 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.2 
 
 
371 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
394 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 
389 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
390 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
409 aa  99.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 
385 aa  99.8  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  30.99 
 
 
378 aa  99.8  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 
371 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
410 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 
395 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
414 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
384 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
385 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
383 aa  96.7  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
381 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
381 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  31.9 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 
424 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
385 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  33.74 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  29.22 
 
 
419 aa  94.4  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 
385 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 
399 aa  94  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 
371 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
399 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.48 
 
 
365 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 
351 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  39.06 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  30.97 
 
 
402 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
378 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
387 aa  91.7  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
446 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  38.38 
 
 
374 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  24.29 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 
361 aa  90.5  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  28.32 
 
 
394 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>