More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3877 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
432 aa  869    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  61.46 
 
 
408 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  61.46 
 
 
408 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  61.82 
 
 
411 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  61.46 
 
 
408 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  61.33 
 
 
411 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0573  putative glycosyl transferase  57.78 
 
 
425 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.478763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  56.35 
 
 
414 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2799  glycosyl transferase, group 1  59.12 
 
 
421 aa  462  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  56.55 
 
 
421 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  58.45 
 
 
452 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  56.17 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0391  glycosyl transferase group 1  56.93 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  52.56 
 
 
458 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3591  glycosyl transferase group 1  51.67 
 
 
416 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  51.74 
 
 
467 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  44.42 
 
 
421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  41.67 
 
 
471 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  43.03 
 
 
457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  41.57 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2006  glycosyl transferase, group 1  38.28 
 
 
431 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0489  glycosyl transferase group 1  42.72 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.610235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.38 
 
 
388 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
414 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.79 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 
385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  34.33 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3449  glycosyl transferase, group 1  30.15 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.455826  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.42 
 
 
351 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
438 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.68 
 
 
443 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.68 
 
 
443 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  27.17 
 
 
364 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
439 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
394 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
439 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.68 
 
 
498 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.68 
 
 
443 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.68 
 
 
499 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.68 
 
 
443 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.68 
 
 
495 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.68 
 
 
427 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
413 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
369 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
382 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
375 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
439 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
400 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
434 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  25.66 
 
 
423 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
425 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
422 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
361 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  27.59 
 
 
428 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29 
 
 
403 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
408 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
438 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
438 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
361 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  26.86 
 
 
353 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  31.74 
 
 
394 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
426 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
415 aa  102  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 
385 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.16 
 
 
536 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
384 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
437 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
371 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
374 aa  102  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
437 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  24.6 
 
 
404 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
370 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
378 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
360 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
395 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  23.87 
 
 
422 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  25.39 
 
 
406 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
382 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
417 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
430 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
389 aa  100  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
390 aa  100  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
378 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.79 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 
353 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  31.45 
 
 
413 aa  99.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.95 
 
 
408 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  29.29 
 
 
397 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  30.75 
 
 
375 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.91 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>