More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0013 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
389 aa  779    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
399 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 
379 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 
362 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  32.78 
 
 
468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  32.43 
 
 
413 aa  113  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
381 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 
368 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  30.39 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  30.39 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
361 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
387 aa  110  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  31.76 
 
 
349 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
367 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
374 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  38.6 
 
 
424 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
348 aa  106  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 
360 aa  106  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
382 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.84 
 
 
366 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  33.76 
 
 
344 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
375 aa  104  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
371 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
369 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 
371 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  26.67 
 
 
370 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 
443 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 
443 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
372 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 
443 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 
443 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.56 
 
 
498 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 
414 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.99 
 
 
495 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.99 
 
 
499 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 
401 aa  99.8  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  31.75 
 
 
810 aa  99.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
409 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
409 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  36.48 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  29.02 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  36.28 
 
 
438 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
352 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.02 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  27.92 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
432 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 
439 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  24.7 
 
 
379 aa  96.7  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
439 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
439 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
391 aa  96.3  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
377 aa  96.3  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
385 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
438 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1608  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372835  normal  0.872915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  32.8 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.43 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
383 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.77 
 
 
371 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
373 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
360 aa  94  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  25.23 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
408 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
819 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.63 
 
 
367 aa  93.6  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
408 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  31.87 
 
 
408 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 
344 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.46 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
822 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
383 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
821 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
672 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
411 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  20.37 
 
 
377 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
821 aa  91.3  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.23 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  34.84 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
411 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>