More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1433 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
409 aa  822    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  45.84 
 
 
406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.3 
 
 
407 aa  332  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  44.78 
 
 
406 aa  325  7e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  43.07 
 
 
411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  38.21 
 
 
414 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
409 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  38.42 
 
 
407 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.66 
 
 
400 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  38.33 
 
 
430 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
426 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 
400 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
411 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  37.66 
 
 
408 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
400 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  38.35 
 
 
440 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  37 
 
 
405 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
404 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  36.34 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
407 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 
401 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  34.95 
 
 
452 aa  182  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
410 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
420 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
420 aa  171  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  34.24 
 
 
417 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
415 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.65 
 
 
417 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  32.27 
 
 
403 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
422 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
422 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  30.75 
 
 
411 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
409 aa  153  5e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
416 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  31.59 
 
 
425 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
410 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 
400 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.68 
 
 
414 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
407 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
410 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
426 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
454 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
452 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
437 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  32.37 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
371 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
413 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  30.11 
 
 
654 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 
373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  39.69 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  41.15 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 
360 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
410 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
426 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.68 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  39.53 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.68 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2129  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.83 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.7 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.76 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  37.71 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
409 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  40.69 
 
 
362 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
358 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
406 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.89 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.59 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.49 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.56 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.59 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  36.36 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.59 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  36.23 
 
 
394 aa  111  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  43.58 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  36.04 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
415 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
392 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
348 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
405 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
375 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
427 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
395 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  31.42 
 
 
412 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>