More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2280 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
367 aa  768    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  37.26 
 
 
354 aa  235  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3042  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  33.42 
 
 
337 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1250  glycosyl transferase WbyK, group 1 family protein  33.42 
 
 
337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157678  hitchhiker  0.000000000000131869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3184  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
337 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.262966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
368 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  31.27 
 
 
377 aa  159  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
366 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
366 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
375 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
374 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  34.58 
 
 
501 aa  135  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
382 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
395 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
377 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
394 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2932  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  34.22 
 
 
1770 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
360 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
444 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  31.41 
 
 
370 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
366 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
369 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3164  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
442 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
370 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
434 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  32.95 
 
 
430 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
370 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
374 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
387 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
387 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.37 
 
 
1739 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
417 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  31.27 
 
 
381 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 
382 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
378 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.66 
 
 
375 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  25.75 
 
 
351 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.96 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
393 aa  115  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 
357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  30.35 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.14 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  30.14 
 
 
372 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
2490 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
378 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
831 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
428 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
373 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  29.04 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0349  glycosyl transferase, group 1  31.7 
 
 
1043 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126249  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  29.02 
 
 
381 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
356 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  30.9 
 
 
364 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  29.96 
 
 
336 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
381 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  29.02 
 
 
381 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
371 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
535 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
1261 aa  106  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
382 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.93 
 
 
374 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  40 
 
 
381 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
375 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
394 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
371 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 
381 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
1028 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
376 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
1241 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
369 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
395 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  27.74 
 
 
859 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
394 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
366 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.58 
 
 
380 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
524 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  31.58 
 
 
419 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
1398 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
860 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
393 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
381 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>