More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2565 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 418 aa  857    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  47.09 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  44.66 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  44.09 
 
 		 414 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  40.72 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  40.48 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  38.65 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 		 431 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  36.54 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 		 441 aa  246  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  35.41 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.81 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 		 422 aa  226  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  35.43 
 
 		 2401 aa  222  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  31.69 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 		 430 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  35.08 
 
 		 404 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 		 424 aa  166  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  29.78 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 437 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 		 362 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 		 746 aa  96.3  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 		 393 aa  93.6  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2121  glycosyltransferase-like protein  27.13 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.41241  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.2 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 		 379 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 372 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 		 379 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 820 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 360 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.7 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  26.7 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  26.7 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  26.7 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.7 
 
 		 381 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  29.09 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  22.06 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 		 373 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.85 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.03 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.24 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 390 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.79 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.73 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2295  putative glycosyl transferase  24.54 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0600773  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 689 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.85 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 		 411 aa  77  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.5 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2671  putative glycosyl transferase  24.48 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  27.51 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>