258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2121 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2121  glycosyltransferase-like protein  100 
 
 		 391 aa  801    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.41241  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.29 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.97 
 
 		 2401 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  24.44 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3356  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.25857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  24.62 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0759  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.241053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  22.54 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  23.02 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50490  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol (GPI) biosynthetic protein  25.95 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0309311  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 		 768 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 440 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1311  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  38.75 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  25.65 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 		 428 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 507 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  39.71 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  24.09 
 
 		 405 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  31.82 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  24.09 
 
 		 405 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  36.76 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  31.82 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  24.09 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  24.09 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2350  putative glycosyl transferase  24.09 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  24.09 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  24.44 
 
 		 405 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 		 419 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 377 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  40.85 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  37.08 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.31 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  30.91 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3261  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.01 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0574  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.57518  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49124  predicted protein  26.98 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.469563  normal  0.18765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4589  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 376 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  45.1 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4287  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 346 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3569  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 460 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3803  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.551552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 344 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3301  glycosyltransferase  35.44 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 322 aa  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  21.11 
 
 		 445 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  35.44 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  24.63 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.78 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  38.03 
 
 		 382 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0317  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 343 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  39.06 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  32.94 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4766  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46838  normal  0.574205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.14 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0553  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  39.06 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 377 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  39.06 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2241  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  33.33 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  34.92 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  26.02 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  26.02 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0457  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.217311  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>