More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0185 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  100 
 
 		 343 aa  713    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  100 
 
 		 343 aa  713    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  54.52 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 342 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 344 aa  223  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.92 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0292  glycosyltransferase  29.12 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000491136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  32.29 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 		 373 aa  99.4  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 		 411 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 406 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 364 aa  95.9  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 396 aa  95.9  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 		 507 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00458  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.94 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 381 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  27.63 
 
 		 343 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  28.24 
 
 		 347 aa  92.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0256  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.89 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.86 
 
 		 381 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 383 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.86 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.06 
 
 		 419 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 381 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 536 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.25 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.25 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  30.25 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  30.25 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  29.72 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  30.25 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.25 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 389 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.04 
 
 		 409 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 370 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  24.7 
 
 		 394 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0604  a-glycosyltransferase  21.41 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 		 366 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  23.84 
 
 		 426 aa  86.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 361 aa  86.3  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 401 aa  86.3  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 378 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 395 aa  85.9  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.03 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.49 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  34.03 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 821 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  22.83 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 		 819 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 		 822 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.46 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.08 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  28.09 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  24.16 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.6 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 750 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 363 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4657  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5012  group 1 family glycosyl transferase  25 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  24.44 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  24.59 
 
 		 820 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.34 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  26.39 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 373 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>