More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0457 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0457  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
381 aa  787    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.217311  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
373 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
373 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  27.4 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.5 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1456  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.550034  hitchhiker  0.000088456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.26 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1760  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.266862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.09 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
689 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
392 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  30.07 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.79 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.12 
 
 
407 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.07 
 
 
351 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 
390 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.48 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0769  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1683  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.33 
 
 
400 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  23.24 
 
 
367 aa  67  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.63 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
400 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
384 aa  66.2  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  28.65 
 
 
360 aa  65.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 
365 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
384 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0362  lipopolysaccharide synthesis sugar transferase  35.19 
 
 
598 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  33.76 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  29.73 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14171  hypothetical protein  24.65 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.700339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
411 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
384 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
389 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>