More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2610 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
378 aa  734    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  43.77 
 
 
382 aa  256  6e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1830  glycosyl transferase group 1  48.13 
 
 
373 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
395 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
402 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  24.81 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.32 
 
 
415 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
395 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
411 aa  99.4  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.92 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  39.38 
 
 
356 aa  93.6  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
382 aa  93.6  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  22.74 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.15 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
388 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
399 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.21 
 
 
383 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  26.7 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  22.89 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  26.67 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
658 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  24.66 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6395  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.229647 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  21.52 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.91 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  23.23 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.76 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  26.57 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.13 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  33.53 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  24 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0457  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.217311  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
381 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.26 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
396 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  22.01 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  21.97 
 
 
388 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2161  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  33.19 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  21.59 
 
 
689 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  29.13 
 
 
363 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
396 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.76 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
364 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
393 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.3 
 
 
404 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
397 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
374 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
388 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5302  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
351 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>