More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3576 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
415 aa  851    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  44.56 
 
 
426 aa  321  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  45.8 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  40.76 
 
 
440 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 
410 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  37.2 
 
 
412 aa  236  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  36.43 
 
 
403 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.92 
 
 
407 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 
454 aa  206  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  32.91 
 
 
406 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
416 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
411 aa  186  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
409 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
417 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
417 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
422 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
422 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  33.6 
 
 
420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 
401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  31.59 
 
 
401 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
409 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
414 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.06 
 
 
409 aa  156  8e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  29.32 
 
 
452 aa  153  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  31.81 
 
 
405 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
410 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  28 
 
 
414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
407 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
417 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
452 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
400 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  29.3 
 
 
406 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  29.3 
 
 
406 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
400 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
411 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  40 
 
 
406 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.53 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.16 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  37.62 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.43 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  29.23 
 
 
406 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.46 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.74 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  38.97 
 
 
406 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
404 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.5 
 
 
406 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 
437 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  25.66 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
1302 aa  114  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
383 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
413 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 
904 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 
359 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
395 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
405 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  26.7 
 
 
443 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  34.05 
 
 
381 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
394 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  29.55 
 
 
654 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 
395 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
355 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
439 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 
360 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.79 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
689 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
360 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
355 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.55 
 
 
379 aa  96.7  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  25.87 
 
 
473 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
371 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
380 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
404 aa  93.6  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.41 
 
 
395 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
390 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>