More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6471 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
405 aa  778    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  84.22 
 
 
413 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  66.42 
 
 
426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  54.07 
 
 
411 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  52.61 
 
 
415 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  51.61 
 
 
415 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  51.86 
 
 
415 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  52.49 
 
 
414 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  39.24 
 
 
416 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  37.63 
 
 
420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  37.63 
 
 
420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 
410 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
409 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
417 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  38.2 
 
 
454 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  38.93 
 
 
452 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 
422 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 
422 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  37.12 
 
 
443 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  36.15 
 
 
414 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 
425 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
414 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
409 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  34.47 
 
 
417 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
426 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 
430 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
452 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
403 aa  129  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
412 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
440 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.91 
 
 
409 aa  123  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  32.45 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
410 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  31.75 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
401 aa  112  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 
401 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
406 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
411 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  29.12 
 
 
654 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  34.24 
 
 
419 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
410 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  36.4 
 
 
409 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  30.26 
 
 
404 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.76 
 
 
367 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
406 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 
407 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
374 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 
414 aa  99.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  39.3 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.98 
 
 
406 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.48 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  39.49 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.87 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.04 
 
 
406 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 
407 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  26.04 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.46 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  38.12 
 
 
412 aa  94  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
381 aa  93.2  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.46 
 
 
406 aa  93.2  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
400 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  40.51 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
395 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
359 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  35.55 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  42.02 
 
 
366 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  37.25 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  35.27 
 
 
386 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  32.8 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  32.8 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
410 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.2 
 
 
400 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  33.65 
 
 
904 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.02 
 
 
427 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
411 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.15 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
439 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.15 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
401 aa  87.4  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
406 aa  87  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.15 
 
 
406 aa  87  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.15 
 
 
406 aa  87  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
455 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
373 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
408 aa  86.3  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>