More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01950 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  100 
 
 
406 aa  838    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  98.03 
 
 
406 aa  819    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  97.54 
 
 
406 aa  799    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  85.71 
 
 
406 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  85.96 
 
 
406 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  838    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  98.28 
 
 
406 aa  821    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  97.29 
 
 
406 aa  793    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  86.21 
 
 
406 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  98.03 
 
 
406 aa  822    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  85.47 
 
 
406 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  98.03 
 
 
406 aa  822    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  86.45 
 
 
406 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  83.25 
 
 
406 aa  693    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  38.98 
 
 
419 aa  262  8.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
373 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
904 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
422 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
422 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
359 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
415 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
417 aa  136  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.04 
 
 
440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  28.61 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  31.95 
 
 
391 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
367 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
420 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 
420 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
426 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
410 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  26.75 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
416 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.51 
 
 
407 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  41.57 
 
 
454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
414 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
406 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
395 aa  113  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0173  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 
401 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
406 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0279  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.887437  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  26.37 
 
 
452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
410 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
395 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
401 aa  109  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  28.95 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 
374 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
400 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.27 
 
 
400 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.68 
 
 
409 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
407 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.54 
 
 
394 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
417 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
417 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
417 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
381 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
407 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 
412 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
409 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  26.23 
 
 
405 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
411 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
405 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 
404 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
401 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 
410 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  27.54 
 
 
411 aa  96.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  38.46 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3213  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
350 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
415 aa  93.2  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
400 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
455 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
1302 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 
377 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
383 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
348 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0017  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
366 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0190487  normal  0.0199927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
377 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2963  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
383 aa  89.7  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.160992  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1522  putative glycosyltransferase  26.97 
 
 
371 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.52 
 
 
396 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
473 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
369 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
373 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  25.72 
 
 
443 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>