More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1501 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  80.54 
 
 
410 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
412 aa  822    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 
415 aa  236  7e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  42.75 
 
 
426 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  41.09 
 
 
440 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  41.69 
 
 
430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
409 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  32.62 
 
 
406 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.91 
 
 
407 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  33.75 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  35.19 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.29 
 
 
409 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  33.25 
 
 
401 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
426 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
405 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
409 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  36.75 
 
 
410 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.21 
 
 
405 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 
414 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  38.83 
 
 
401 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
422 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 
417 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
407 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  36.01 
 
 
416 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
407 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 
404 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  31.66 
 
 
414 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
454 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
410 aa  137  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
420 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
420 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.71 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  28.54 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  25.92 
 
 
419 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  30.43 
 
 
411 aa  126  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
400 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
373 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
400 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
395 aa  117  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
904 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  31.81 
 
 
414 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
415 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
405 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
367 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
403 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
378 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  29.41 
 
 
443 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
394 aa  107  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
360 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
415 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.65 
 
 
406 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.65 
 
 
406 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 
359 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
377 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
415 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.97 
 
 
406 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.57 
 
 
406 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
370 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
386 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.84 
 
 
406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
395 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.12 
 
 
406 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.84 
 
 
406 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.54 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  34.69 
 
 
377 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.01 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  26.74 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
386 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
440 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  34 
 
 
401 aa  93.2  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
437 aa  92.8  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  37.11 
 
 
406 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  37.11 
 
 
406 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  34.91 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
375 aa  90.5  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0172  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
374 aa  90.1  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0363337  normal  0.131519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>