More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3866 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 1302 aa  2655    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 		 417 aa  124  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 		 454 aa  119  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 422 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 422 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 415 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 		 417 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 430 aa  108  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 440 aa  108  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  28.73 
 
 		 414 aa  107  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 410 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 425 aa  107  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 416 aa  107  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 417 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 417 aa  105  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 		 426 aa  105  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.37 
 
 		 406 aa  102  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  27.69 
 
 		 452 aa  102  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.88 
 
 		 406 aa  102  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.88 
 
 		 406 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.88 
 
 		 406 aa  101  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 406 aa  101  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.4 
 
 		 406 aa  99.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 420 aa  100  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 420 aa  100  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 410 aa  100  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 409 aa  98.6  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 415 aa  95.1  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 383 aa  93.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  30.92 
 
 		 406 aa  91.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  30.92 
 
 		 406 aa  91.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 380 aa  90.1  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 680 aa  89.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 		 409 aa  89.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 395 aa  88.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 410 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.73 
 
 		 406 aa  87.8  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.13 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  34.13 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  31.67 
 
 		 403 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  33.53 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  30.64 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  37.57 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 394 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  47.56 
 
 		 746 aa  83.2  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  28.44 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2576  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 377 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496816  normal  0.101525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  48.81 
 
 		 665 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  50.68 
 
 		 849 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 410 aa  80.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 412 aa  80.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 377 aa  80.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.08 
 
 		 407 aa  80.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  50 
 
 		 1632 aa  79.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  36.72 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  50 
 
 		 1806 aa  79  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  47.22 
 
 		 1152 aa  78.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  47.22 
 
 		 1152 aa  78.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 904 aa  78.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 411 aa  77.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 403 aa  77  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  50 
 
 		 1476 aa  77  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 379 aa  77  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 360 aa  77.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 		 445 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25631  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 377 aa  77  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2695  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 376 aa  77  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02930  glycosyltransferase  26.14 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  27.46 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  45.98 
 
 		 592 aa  75.5  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 1177 aa  75.5  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  47.95 
 
 		 857 aa  75.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.77 
 
 		 423 aa  74.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2790  glycosyl transferase group 1  38.17 
 
 		 387 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 415 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2609  glycosyl transferase, group 1  37.04 
 
 		 376 aa  74.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 		 374 aa  74.3  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  48.05 
 
 		 115 aa  74.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 		 384 aa  74.7  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 473 aa  74.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  48 
 
 		 120 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  23.84 
 
 		 1177 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 455 aa  73.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 373 aa  73.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 412 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  38.28 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>