More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0205 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
379 aa  751    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  50.77 
 
 
409 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  50.52 
 
 
409 aa  333  3e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  50.52 
 
 
409 aa  333  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  50.4 
 
 
382 aa  333  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  50.4 
 
 
388 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  51.55 
 
 
409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
428 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  50 
 
 
431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  46.36 
 
 
432 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  44.65 
 
 
434 aa  265  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  46.93 
 
 
379 aa  241  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  34.61 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 
383 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  29.52 
 
 
358 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
371 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  35.22 
 
 
374 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
372 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  34.99 
 
 
376 aa  159  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  33.68 
 
 
387 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 
376 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  34.73 
 
 
370 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 
374 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 
344 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  35.94 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  40.42 
 
 
468 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
370 aa  121  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3867  glycosyl transferase group 1  36.82 
 
 
819 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.709637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  36.82 
 
 
822 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4608  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
821 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2111  glycosyl transferase, group 1  36.82 
 
 
821 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.356512 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  41.41 
 
 
820 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1970  glycosyl transferase group 1  37.55 
 
 
818 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.928002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2228  putative first mannosyl transferase, WbaZ  36.68 
 
 
820 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0572905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1074  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 
828 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.33543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 
396 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0695  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.21 
 
 
857 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1705  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.11 
 
 
856 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.942867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.36 
 
 
425 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0752  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.11 
 
 
856 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4393  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
821 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465911  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3555  glycosyl transferase group 1  37.7 
 
 
821 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0861248  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3974  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
821 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0546  glycosyl transferase group 1 family protein  40.11 
 
 
820 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1666  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.11 
 
 
820 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.744224  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1874  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.11 
 
 
820 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2427  glycosyl transferase group 1 family protein  40.11 
 
 
820 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
369 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
385 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
406 aa  101  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
439 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
439 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 
439 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
438 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
393 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  23.13 
 
 
379 aa  99.8  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
378 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.66 
 
 
423 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
335 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
415 aa  96.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
410 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
438 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
385 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  31.56 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.53 
 
 
443 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.53 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.53 
 
 
443 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.53 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.25 
 
 
498 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 
495 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
424 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 
499 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
453 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  26.94 
 
 
383 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
383 aa  93.6  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 
422 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
417 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
398 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
871 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
394 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
743 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  28.12 
 
 
745 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  31.71 
 
 
420 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
820 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
408 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 
482 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.23 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  35.5 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
381 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  22.87 
 
 
350 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25 
 
 
745 aa  89.7  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>