83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6737 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  241  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  85.84 
 
 		 120 aa  204  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  64.44 
 
 		 644 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  56.7 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  56.7 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  62.65 
 
 		 227 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  56.7 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  53.19 
 
 		 355 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  56.41 
 
 		 322 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  58.11 
 
 		 1632 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  58.11 
 
 		 1806 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  59.3 
 
 		 361 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  57.33 
 
 		 255 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  59.3 
 
 		 361 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  54.93 
 
 		 2342 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  54.93 
 
 		 2342 aa  87  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  58.9 
 
 		 680 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  57.75 
 
 		 849 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  50.62 
 
 		 678 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  57.75 
 
 		 872 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  45.74 
 
 		 592 aa  84.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  57.83 
 
 		 361 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  55.41 
 
 		 2796 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  52.11 
 
 		 746 aa  82  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  54.17 
 
 		 521 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  43.3 
 
 		 665 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  49.3 
 
 		 1152 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  49.3 
 
 		 1152 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  47.5 
 
 		 1264 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  56.45 
 
 		 857 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  47.22 
 
 		 1067 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  55.56 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  55.26 
 
 		 1059 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  55.26 
 
 		 1035 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  33.86 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  56.45 
 
 		 995 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  48.05 
 
 		 1302 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  52.11 
 
 		 1476 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  47.14 
 
 		 535 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  50.79 
 
 		 294 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  49.23 
 
 		 1322 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  49.23 
 
 		 1313 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 		 814 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  50.79 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  47.89 
 
 		 987 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 1247 aa  63.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  41.33 
 
 		 1161 aa  62  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  37.78 
 
 		 1366 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  45.07 
 
 		 756 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  45.07 
 
 		 1317 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  38.04 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  43.59 
 
 		 1044 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  40.62 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1880 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.04 
 
 		 418 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  40 
 
 		 597 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  40.51 
 
 		 751 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  40.51 
 
 		 751 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  49.06 
 
 		 1162 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  52.17 
 
 		 399 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  40.28 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1313 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  40.79 
 
 		 235 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  42.67 
 
 		 1236 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 830 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3867  hypothetical protein  56.41 
 
 		 296 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  38.55 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  39.51 
 
 		 462 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.14 
 
 		 916 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  40.74 
 
 		 603 aa  48.9  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  38.96 
 
 		 846 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 		 1075 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  57.58 
 
 		 828 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 		 995 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  46.67 
 
 		 801 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  60.61 
 
 		 668 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 		 2296 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  52.94 
 
 		 461 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 		 1301 aa  43.9  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  39.68 
 
 		 793 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  47.92 
 
 		 1301 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1185  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 1334 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>