More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2009 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  100 
 
 
1806 aa  3541    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  92.55 
 
 
1632 aa  2336    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  59.21 
 
 
2796 aa  365  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  59.21 
 
 
2342 aa  350  2e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  59.21 
 
 
2342 aa  349  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  41.69 
 
 
481 aa  201  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5120  amidase family protein  44.58 
 
 
519 aa  190  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  40.08 
 
 
849 aa  185  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1921  amidase  41.42 
 
 
491 aa  181  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0759048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3247  amidase  41.42 
 
 
491 aa  180  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  0.198397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2171  amidase  42.16 
 
 
491 aa  181  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1779  Amidase  41.64 
 
 
526 aa  178  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  0.676292 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2143  amidase  41.79 
 
 
491 aa  177  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2061  amidase  40.74 
 
 
491 aa  176  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00865989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1887  amidase  42.59 
 
 
491 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  42.86 
 
 
540 aa  174  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1877  amidase  41.83 
 
 
491 aa  174  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2103  amidase  41.89 
 
 
491 aa  174  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1925  amidase  42.26 
 
 
491 aa  172  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.734748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2072  amidase  42.26 
 
 
491 aa  172  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1946  amidase  42.16 
 
 
488 aa  170  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  43.22 
 
 
540 aa  170  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4304  amidase  40.66 
 
 
505 aa  169  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1782  amidase  35.69 
 
 
536 aa  164  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1921  amidase  35.69 
 
 
536 aa  164  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.246226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1957  amidase  35.37 
 
 
536 aa  164  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000744293 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1796  amidase  36.2 
 
 
536 aa  163  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00691458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3418  amidase  36.56 
 
 
536 aa  163  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1739  amidase  35.37 
 
 
536 aa  162  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.138161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1925  amidase  36.56 
 
 
536 aa  161  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2026  amidase  34.73 
 
 
536 aa  158  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00167874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1761  amidase  35.05 
 
 
536 aa  158  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2005  amidase  35.84 
 
 
533 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.512259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0894  Amidase  40.29 
 
 
475 aa  154  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
1067 aa  153  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1943  Amidase  41.07 
 
 
574 aa  151  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00712405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1019  amidase  37.29 
 
 
610 aa  150  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.46113  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2294  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit or related amidase  37.99 
 
 
536 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03934  amidase  42.7 
 
 
544 aa  149  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59934  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2061  amidase  42.46 
 
 
528 aa  147  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2352  amidase  42.46 
 
 
528 aa  147  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3121  amidase  42.46 
 
 
528 aa  147  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1087  amidase  42.46 
 
 
528 aa  147  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1369  amidase  42.46 
 
 
528 aa  147  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3236  amidase  42.46 
 
 
528 aa  147  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.595988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1454  amidase  42.74 
 
 
528 aa  146  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  74.75 
 
 
361 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  74.75 
 
 
361 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05965  amidase  37.5 
 
 
542 aa  144  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316578  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  48.45 
 
 
361 aa  142  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2331  amidase  43.89 
 
 
540 aa  142  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2929  Amidase  41.32 
 
 
519 aa  141  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.669422 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2754  Amidase  40.98 
 
 
533 aa  140  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.518277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3426  amidase  36.39 
 
 
520 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000155871  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3057  amidase  39.16 
 
 
513 aa  132  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.567901  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1333  amidase  37.79 
 
 
468 aa  132  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3420  amidase  40.56 
 
 
543 aa  130  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 
857 aa  129  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.69 
 
 
485 aa  127  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5142  amidase  34.15 
 
 
499 aa  125  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.935428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  33.09 
 
 
526 aa  124  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  34.98 
 
 
530 aa  119  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
665 aa  118  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30643  Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  35.66 
 
 
581 aa  118  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104467  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
1044 aa  117  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  33.08 
 
 
509 aa  115  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.4 
 
 
483 aa  115  9e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
995 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.34 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  48.31 
 
 
872 aa  113  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.99 
 
 
1366 aa  113  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
1059 aa  113  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
1035 aa  113  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.6 
 
 
486 aa  109  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.87 
 
 
486 aa  109  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  32.23 
 
 
486 aa  108  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  34.63 
 
 
1184 aa  108  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
1264 aa  107  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  45.6 
 
 
746 aa  107  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.69 
 
 
491 aa  107  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  36.13 
 
 
491 aa  107  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.89 
 
 
498 aa  107  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.62 
 
 
475 aa  106  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.96 
 
 
485 aa  106  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  34.59 
 
 
486 aa  105  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2394  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  39.35 
 
 
516 aa  103  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225489  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  37.78 
 
 
470 aa  103  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  30.84 
 
 
476 aa  103  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5750  Amidase  32.64 
 
 
506 aa  103  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180431  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06951  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  32.26 
 
 
592 aa  102  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.71 
 
 
486 aa  102  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10590  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  37.82 
 
 
503 aa  102  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.701412  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  33.7 
 
 
470 aa  102  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.47 
 
 
488 aa  101  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8074  Amidase  36.16 
 
 
496 aa  100  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4413  Amidase  36.36 
 
 
559 aa  101  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.216813  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.19 
 
 
485 aa  99.8  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
987 aa  99.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  39.88 
 
 
521 aa  99.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0163  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.67 
 
 
499 aa  99.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>