More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0738 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  100 
 
 
443 aa  905    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  51.72 
 
 
410 aa  398  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  47.46 
 
 
416 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  38.7 
 
 
420 aa  276  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  38.7 
 
 
420 aa  276  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  40.72 
 
 
454 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
422 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  36.34 
 
 
422 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
415 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  38.08 
 
 
414 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 
417 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  36.82 
 
 
411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  37.38 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
409 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  37.14 
 
 
415 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  38.66 
 
 
425 aa  206  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 
426 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  34.05 
 
 
414 aa  196  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
405 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  36.49 
 
 
413 aa  183  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  34.54 
 
 
452 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
417 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
452 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  34.89 
 
 
430 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 
410 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 
411 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
417 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
406 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
400 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 
404 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 
426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
440 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.37 
 
 
409 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.68 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  31.57 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
406 aa  139  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.47 
 
 
400 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.65 
 
 
405 aa  136  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.65 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4012  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 
400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
412 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
415 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2056  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
473 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
407 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  29.52 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.63 
 
 
373 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
377 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  27.79 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 
407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  32.86 
 
 
359 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  28.29 
 
 
406 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  28.29 
 
 
406 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.3 
 
 
408 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
406 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
904 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5179  glycosyl transferase group 1  33.22 
 
 
378 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
367 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.78 
 
 
406 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.79 
 
 
406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  28.54 
 
 
406 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  28.22 
 
 
406 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
406 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.81 
 
 
406 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.7 
 
 
406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  24.91 
 
 
654 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 
360 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.23 
 
 
406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
396 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.27 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.89 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.63 
 
 
406 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
1302 aa  96.3  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
394 aa  94  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  23.94 
 
 
419 aa  93.6  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
395 aa  93.2  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.85 
 
 
360 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
394 aa  92.4  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
410 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
360 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0783  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.492233  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
412 aa  87.4  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2124  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.51 
 
 
391 aa  87  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
371 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>