More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1004 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
408 aa  817    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  61.4 
 
 
400 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  60 
 
 
411 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  60.1 
 
 
400 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  60.1 
 
 
400 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  49.38 
 
 
407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  46.77 
 
 
404 aa  338  9e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  51.26 
 
 
401 aa  335  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  48.48 
 
 
405 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  48.48 
 
 
405 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  48.99 
 
 
407 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  37.19 
 
 
409 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3184  glycosyl transferase, group 1  44.11 
 
 
400 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.845721  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  37.47 
 
 
411 aa  249  5e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
414 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.66 
 
 
409 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  38.13 
 
 
406 aa  239  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.32 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  37.44 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  35.31 
 
 
430 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
426 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
417 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  33.89 
 
 
452 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
422 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
422 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5245  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 
410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.844139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 
417 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
440 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
412 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
417 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
415 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  30.67 
 
 
437 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
420 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
420 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
416 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 
426 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.9 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3400  O-antigen polymerase  30.32 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1938  glycosyl transferase, group 1  36.2 
 
 
401 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.792782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2798  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
425 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0488455  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
454 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  30.98 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
452 aa  117  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4244  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.772955 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5975  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.696902  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.8 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.08 
 
 
406 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.27 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.53 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  27.49 
 
 
406 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01950  predicted glycosyl transferase  26.91 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.92 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01939  hypothetical protein  26.91 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.156433  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4597  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
415 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.982264 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0738  glycosyltransferase-like  29.06 
 
 
443 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.77 
 
 
350 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2978  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.11 
 
 
406 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  hitchhiker  0.000111113 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  37.29 
 
 
350 aa  107  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.61 
 
 
411 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 
904 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2658  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
406 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1597  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
406 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.308201  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.63 
 
 
360 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7128  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
415 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1018  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.61 
 
 
406 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 
419 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1613  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
406 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  31.85 
 
 
373 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7223  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
413 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0752663  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
358 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2336  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.7 
 
 
406 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000162166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
364 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1188  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaL  27.13 
 
 
406 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
364 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
360 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 
419 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
398 aa  99.8  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  32.88 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
394 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
358 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02463  putative glycosyl transferase in colanic acid gene cluster  25.84 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00021101  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  34.5 
 
 
392 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.91 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  41.67 
 
 
439 aa  97.1  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
398 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
373 aa  96.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
310 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6471  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214546  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
355 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>