More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1808 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 397 aa  780    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  87.66 
 
 		 419 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  87.66 
 
 		 419 aa  697    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  66.75 
 
 		 399 aa  480  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  62.3 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  61.7 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  45.87 
 
 		 377 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  46.36 
 
 		 378 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  44.59 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  44.2 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  45.31 
 
 		 389 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  44.8 
 
 		 380 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  41.38 
 
 		 375 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  43.97 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 		 389 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  44.71 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 		 389 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  36.68 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  44.03 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.32 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  30.17 
 
 		 419 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 377 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 		 388 aa  90.1  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 395 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 373 aa  90.1  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.61 
 
 		 373 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.55 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.11 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.06 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  27.51 
 
 		 376 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  34.65 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  34.16 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  26.99 
 
 		 935 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  24.52 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05650  glycosyltransferase  37.02 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.520529  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.07 
 
 		 745 aa  84  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  37.36 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.31 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 500 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 904 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.87 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.96 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  36.69 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.3 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.87 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  39.38 
 
 		 739 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.81 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.89 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.55 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  35.97 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  34.12 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.32 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.16 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  31.25 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.16 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>