More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1311 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  95.36 
 
 
389 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
389 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  62.57 
 
 
389 aa  507  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  56.8 
 
 
378 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  50.54 
 
 
375 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  47.3 
 
 
387 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  39.63 
 
 
377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  38.61 
 
 
377 aa  262  8.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  40.11 
 
 
378 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  40.56 
 
 
377 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  39.38 
 
 
419 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 
419 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  40.92 
 
 
384 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  39.52 
 
 
397 aa  248  9e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 
468 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  38.34 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 
380 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  38.32 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  38.3 
 
 
416 aa  229  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  38.68 
 
 
406 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
394 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
358 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  24.4 
 
 
400 aa  102  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  27.95 
 
 
353 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
377 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.16 
 
 
388 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
367 aa  94  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
369 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
407 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3115  group 1 glycosyl transferase  25.89 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.71 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 
405 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.88 
 
 
356 aa  86.3  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  24.73 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  27.2 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  22.92 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.99 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  28.62 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  24.94 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  38.85 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  24.27 
 
 
390 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 
355 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
689 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1102  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
358 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.65 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  24.61 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
407 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0496  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
373 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.47 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.19 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.01 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  22.19 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1139  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0404734  normal  0.023827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.52 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.1 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  24.1 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 
391 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>