More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2956 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 468 aa  899    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  81.2 
 
 		 416 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  61.76 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  61.76 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  62.3 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  61.48 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  47.47 
 
 		 377 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  48.79 
 
 		 377 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  48.14 
 
 		 377 aa  308  9e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  48.4 
 
 		 378 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  47.34 
 
 		 389 aa  289  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  45.58 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  45.65 
 
 		 384 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  40.65 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  41.75 
 
 		 387 aa  259  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  41.73 
 
 		 375 aa  259  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  41.02 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  40.41 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  41.52 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.82 
 
 		 394 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  33.01 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 373 aa  97.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 414 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 505 aa  90.9  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  30.39 
 
 		 419 aa  90.5  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  34.05 
 
 		 364 aa  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 377 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 372 aa  89.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  40.34 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 364 aa  87.8  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  35.44 
 
 		 384 aa  87.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2727  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 403 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 366 aa  87  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  42.7 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.87 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  29.39 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.16 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  25.23 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.29 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 		 369 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.29 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.19 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.24 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 396 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  30.96 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  35.32 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2649  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 381 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.41535  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 468 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 401 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 304 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  37.75 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  31.6 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  29.23 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.64 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.27 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0635  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152799  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>