More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1857 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 419 aa  824    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  87.66 
 
 		 397 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  98.81 
 
 		 419 aa  815    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  67.27 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  61.76 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  61.17 
 
 		 416 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  44.35 
 
 		 377 aa  292  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  45.82 
 
 		 378 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  44.32 
 
 		 377 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  42.97 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  44.53 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  43.28 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  45.09 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  43.4 
 
 		 387 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  42.9 
 
 		 375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  39.38 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  37.77 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  43.99 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.32 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 394 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  30.26 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 388 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 		 360 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 395 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 370 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0840  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 367 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  35.12 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 377 aa  86.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 358 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  31.73 
 
 		 371 aa  86.3  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 		 904 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.25 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  35.43 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2440  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.11 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788378 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  23.23 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  32.83 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  33.63 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1993  putative glycosyltransferase  30.34 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00985671  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2326  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32.4 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45919  normal  0.147649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.64 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  36.97 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2282  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  32 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000100013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  37.22 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05650  glycosyltransferase  42.86 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.520529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  26.67 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.71 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2225  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  31.77 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.044252  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 353 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  41.04 
 
 		 739 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1668  glycogen synthase  33.17 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  34.53 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  31.11 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  37.78 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  31.9 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  30.3 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  27.9 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1022  hypothetical protein  30.14 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>