More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2683 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 384 aa  753    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  74.59 
 
 		 377 aa  560  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  77.57 
 
 		 378 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  75.6 
 
 		 380 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  73.44 
 
 		 377 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  75.8 
 
 		 389 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  71.89 
 
 		 377 aa  521  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  46.7 
 
 		 468 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  46.72 
 
 		 416 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  45.36 
 
 		 419 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  45.09 
 
 		 419 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  45.86 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  40.1 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  44.97 
 
 		 397 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  43.3 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  38.62 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  38.87 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  40.5 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  34.2 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  29.63 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.27 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 		 373 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 		 377 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 739 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  23.05 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 1080 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 		 373 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.16 
 
 		 389 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.45 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3804  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 750 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  22.9 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  31.36 
 
 		 447 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  32.29 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  21.41 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2743  glycosyl transferase group 1  34.83 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.22 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  21.24 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.22 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.53 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  22.22 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  35 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  22.22 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  26.81 
 
 		 783 aa  75.1  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.7 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  22.05 
 
 		 689 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  36.43 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1798  glycosyltransferase  28.93 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.8 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  33.71 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.27 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.82 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.22 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.5 
 
 		 745 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>