More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3263 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
425 aa  845    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  66.11 
 
 
414 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  68.02 
 
 
412 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  68.02 
 
 
412 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  65.87 
 
 
410 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  68.02 
 
 
412 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  67.94 
 
 
410 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  61.47 
 
 
435 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  59.43 
 
 
417 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  57.52 
 
 
417 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  45.73 
 
 
414 aa  306  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  45.98 
 
 
438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  45.08 
 
 
464 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 
446 aa  232  9e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  38.14 
 
 
396 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 
395 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  34.55 
 
 
408 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  39.16 
 
 
935 aa  226  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
536 aa  225  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 
410 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
419 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 
415 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  39.84 
 
 
353 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
417 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 
414 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
387 aa  209  6e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
396 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 
396 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  35.15 
 
 
396 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
413 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
391 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33 
 
 
390 aa  204  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  33.17 
 
 
395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
402 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  34.16 
 
 
399 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.79 
 
 
398 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  31.93 
 
 
396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  33.25 
 
 
395 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  34.24 
 
 
395 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
391 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  31.86 
 
 
397 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
391 aa  186  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  32.27 
 
 
387 aa  156  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
407 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1538  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
379 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  33.57 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  32.66 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  25.12 
 
 
388 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
373 aa  132  9e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  29.1 
 
 
406 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  27.01 
 
 
404 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  29.54 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.59 
 
 
405 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
426 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 
422 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  26.1 
 
 
404 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  30.79 
 
 
396 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
379 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
429 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  26.9 
 
 
395 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
394 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  26.51 
 
 
393 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
379 aa  119  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4408  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.406195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.57 
 
 
403 aa  118  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  28.83 
 
 
398 aa  116  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.23 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  28.11 
 
 
404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  32.29 
 
 
395 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11236  glycosyl transferase  29.93 
 
 
387 aa  114  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000059903  normal  0.0287618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6261  putative glycosyl transferase  28.54 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  26.73 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  27.21 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.54 
 
 
420 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0793  glycogen synthase  30.75 
 
 
395 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
405 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 
537 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.76 
 
 
420 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.23 
 
 
378 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  30.12 
 
 
407 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 
419 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
406 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  28.05 
 
 
416 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
422 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  29.31 
 
 
443 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
689 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  31.48 
 
 
397 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  28.9 
 
 
398 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4504  glycogen synthase  29.6 
 
 
387 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.746384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>