More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1682 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
420 aa  877    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  50.82 
 
 
429 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0470  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 
456 aa  343  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  35.04 
 
 
429 aa  286  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  36.22 
 
 
432 aa  275  9e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
390 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  26.91 
 
 
935 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
414 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
415 aa  143  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
396 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
417 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 
536 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.03 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 
391 aa  126  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.69 
 
 
414 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
398 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
396 aa  123  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
402 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 
353 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.63 
 
 
446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  23.29 
 
 
413 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
435 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 
413 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.6 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 
397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  28.04 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0621  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.152612  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 
395 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  26.8 
 
 
351 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  26.98 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 
414 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 
417 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
366 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  26.22 
 
 
417 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
425 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
396 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
396 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
396 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
395 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1050  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 
349 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.806851  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 
410 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
412 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
412 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 
412 aa  103  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
393 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  22.79 
 
 
414 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
464 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 
410 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
379 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
407 aa  99.8  7e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.93 
 
 
363 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  26.91 
 
 
400 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  28.16 
 
 
406 aa  99.4  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
384 aa  98.2  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1266  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
390 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.610895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
384 aa  97.8  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
399 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
433 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0435  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 
389 aa  96.7  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.113418  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
379 aa  96.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
672 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
422 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0266  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
537 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.99 
 
 
394 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  26.09 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  27.98 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
373 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  23.16 
 
 
404 aa  93.6  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
379 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  25.66 
 
 
383 aa  93.2  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
370 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 
369 aa  93.2  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
363 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4231  glycogen synthase  29.68 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
417 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5426  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
396 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
457 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.96 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  27.41 
 
 
336 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  24.67 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  27.85 
 
 
398 aa  90.9  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 
374 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  23.93 
 
 
370 aa  90.5  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  28.94 
 
 
476 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1368  hypothetical protein  26.67 
 
 
393 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>