More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0586 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
365 aa  721    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
377 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
398 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
377 aa  123  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
378 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.24 
 
 
394 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  30 
 
 
369 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 
367 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  22.05 
 
 
387 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
399 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
369 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
379 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
367 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
367 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 
374 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  33.05 
 
 
371 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  31.93 
 
 
369 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.93 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.01 
 
 
366 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.93 
 
 
369 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.01 
 
 
366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  21.65 
 
 
391 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.01 
 
 
366 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.01 
 
 
366 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
371 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  26.37 
 
 
366 aa  99.8  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  19.87 
 
 
439 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  28.34 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  26.59 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  21.69 
 
 
381 aa  95.9  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.19 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 
374 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  25.63 
 
 
745 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.6 
 
 
365 aa  93.2  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  26.77 
 
 
368 aa  93.2  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  21.17 
 
 
383 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.63 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
377 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
387 aa  89.7  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 
373 aa  89.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
372 aa  89.4  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
373 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 
359 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  22.18 
 
 
389 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0292  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
365 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1210  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 
373 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0448845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 
363 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
362 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
370 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
377 aa  86.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
414 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
378 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  26.89 
 
 
374 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.64 
 
 
745 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  24.36 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  21.94 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  23.35 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1432  glycosyltransferase  27 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
377 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
1079 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  20.9 
 
 
426 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.17 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  22.54 
 
 
350 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
399 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
412 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  20.39 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  25.84 
 
 
350 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  22.18 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1496  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 
371 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  19.69 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  21.78 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  21.5 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  28.69 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  21.6 
 
 
750 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>