More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1437 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
353 aa  727    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  29.77 
 
 
342 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
350 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  30.28 
 
 
341 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  26.3 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  30.38 
 
 
343 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0264  phosphatidylserine decarboxylase  28.74 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  33.71 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.13 
 
 
371 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 
419 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
377 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
388 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
412 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
384 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
369 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
398 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  35.03 
 
 
410 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  28.71 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
384 aa  99.4  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
382 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
373 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 
377 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
364 aa  96.3  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
378 aa  95.9  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  28.07 
 
 
366 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  28.07 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
409 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.07 
 
 
366 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  28.07 
 
 
366 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
381 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  32.06 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
371 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
370 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
403 aa  92.8  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
476 aa  92.4  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3413  glycosyl transferase group 1  28.22 
 
 
365 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  27.07 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.43 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  27.5 
 
 
384 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0268  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2032  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000150613  hitchhiker  0.0000241672 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
362 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
1080 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
395 aa  89.4  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
369 aa  89.4  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
378 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
390 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
364 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
456 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  32.4 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
762 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 
365 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0662  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 
331 aa  87.8  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0132894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
390 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
371 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
387 aa  87  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
372 aa  87.4  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
367 aa  86.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.5 
 
 
389 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 
378 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
414 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  28.89 
 
 
363 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
396 aa  86.3  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
371 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
387 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
371 aa  85.9  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2575  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
411 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  24.6 
 
 
366 aa  85.9  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
367 aa  85.9  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
367 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
384 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  24.27 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0906  alpha-D-QuiNAc alpha-1,3-galactosyltransferase  23.64 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>