More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0660 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
327 aa  647    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0662  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  35.78 
 
 
331 aa  171  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0132894  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0797  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
337 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  28.52 
 
 
347 aa  97.1  4e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
353 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 
369 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  27.12 
 
 
369 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.45 
 
 
369 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  26.8 
 
 
371 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  26.56 
 
 
366 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
750 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  26.56 
 
 
366 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
366 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  28.43 
 
 
366 aa  93.2  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
395 aa  92.8  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
369 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  26.56 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
335 aa  89.7  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
369 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  34.12 
 
 
374 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
414 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
739 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
367 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  29.2 
 
 
372 aa  86.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
394 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
383 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.58 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  26.71 
 
 
358 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3019  glycosyl transferase group 1  23.79 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  23.91 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
377 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  21.49 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.01 
 
 
465 aa  79.3  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.15 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  23.18 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
374 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  27.97 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.73 
 
 
498 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
350 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  23.45 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  25.55 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  24.36 
 
 
745 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  33.04 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  31.96 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  18.59 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.3 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  21.28 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  23.9 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.07 
 
 
372 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  20.38 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  21.58 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.66 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  21.67 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 
377 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
360 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 
376 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
365 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  25.41 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.12 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4362  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  21.85 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
371 aa  70.1  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  21.2 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  21.2 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  30.68 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  22.04 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
367 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  26.37 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0187  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.61 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  28.25 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  21.83 
 
 
745 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  20.42 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>