More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0056 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 363 aa  736    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 		 369 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0662  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 331 aa  96.7  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0132894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.65 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 412 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 399 aa  86.7  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.13 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2757  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.164612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  23.43 
 
 		 743 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.64 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  24.15 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.68 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.33 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  23.54 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.68 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  24.27 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 		 364 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  24.38 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  25.59 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2380  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1438  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.73 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  21.43 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.23 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.67 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  24.38 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  25.78 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3265  CpsI  23.58 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  21.35 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  25.74 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3214  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.12 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  20.33 
 
 		 360 aa  72.8  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 407 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  28.07 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  23.32 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  23.38 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  23.89 
 
 		 596 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.15 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.51 
 
 		 769 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.72 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  21.64 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  22.67 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  22.38 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  25.94 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 		 461 aa  69.7  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  19.71 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0292  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  23.11 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  25.68 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>