More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0187 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0187  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
376 aa  762    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1616  glycosyl transferase, group 1  42.18 
 
 
358 aa  264  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0191  glycosyl transferase, group 1  42.43 
 
 
364 aa  262  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
385 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.75 
 
 
366 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
346 aa  96.7  5e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  33.89 
 
 
365 aa  94  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.88 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  26.6 
 
 
309 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
390 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  33.33 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  33.33 
 
 
365 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  25.43 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.79 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  21.69 
 
 
386 aa  89.7  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  28.98 
 
 
374 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  27.43 
 
 
377 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.67 
 
 
396 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  23.95 
 
 
375 aa  86.7  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
387 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  22.77 
 
 
348 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  25.82 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3395  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 
399 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  25.97 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  29.95 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  24.27 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  27.89 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  23.86 
 
 
355 aa  77  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  29.95 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1475  glycosyl transferase  31.38 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.16503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  22.07 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  25.4 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
377 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2826  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.342836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  26.42 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.35 
 
 
352 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  23.91 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.04 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.72 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  29.67 
 
 
745 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  25.85 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.86 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  24.68 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
375 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
386 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  23.16 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  28.84 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.16 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  24.51 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  24.75 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  26.36 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  27.31 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.09 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>