More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0958 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
358 aa  719    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  46.33 
 
 
350 aa  290  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  42.61 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  43.3 
 
 
347 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.6 
 
 
352 aa  278  7e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  40.62 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  40.51 
 
 
347 aa  269  5e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  41.41 
 
 
359 aa  268  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  41.13 
 
 
359 aa  268  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  40.56 
 
 
358 aa  263  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  37.5 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  39.89 
 
 
347 aa  249  5e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 
386 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.64 
 
 
396 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
364 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
361 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
357 aa  133  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.78 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  28.78 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
388 aa  115  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
393 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  23.84 
 
 
440 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.12 
 
 
375 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
355 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
669 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 
419 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
388 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  31.01 
 
 
353 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
762 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
409 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.52 
 
 
365 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.25 
 
 
365 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
399 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
390 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.25 
 
 
365 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
392 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
404 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
383 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.42 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  26.7 
 
 
379 aa  97.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  22.56 
 
 
356 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
375 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
890 aa  96.3  8e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  24.83 
 
 
425 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
678 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
808 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.52 
 
 
386 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  30.46 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 
375 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
443 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
390 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
418 aa  90.5  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
660 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.3 
 
 
396 aa  89.7  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
394 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
375 aa  89  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  24.6 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
415 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
420 aa  86.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  31.52 
 
 
358 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  22.34 
 
 
416 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  34.76 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.56 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.81 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
351 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
1264 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  25.3 
 
 
369 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  21.75 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
376 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>