More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1386 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
350 aa  697    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  48.16 
 
 
352 aa  312  5.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  46.18 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  48.16 
 
 
346 aa  301  8.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  46.33 
 
 
358 aa  300  3e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  40.91 
 
 
347 aa  248  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  39.2 
 
 
347 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  41.01 
 
 
347 aa  228  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  39.11 
 
 
359 aa  226  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  38.83 
 
 
358 aa  224  2e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  38.83 
 
 
359 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  36.13 
 
 
354 aa  209  8e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
396 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
355 aa  129  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
361 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.84 
 
 
366 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  28.84 
 
 
366 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
357 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
384 aa  106  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
371 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
364 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
365 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  25.46 
 
 
425 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
392 aa  90.1  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 
404 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.17 
 
 
359 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  25.59 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
365 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.72 
 
 
375 aa  86.3  7e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  24.4 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.89 
 
 
407 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 
390 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  22.65 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  23.36 
 
 
385 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  23.31 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
476 aa  76.6  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  22.13 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  23.28 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  23.76 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  21.45 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  23.44 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  26.58 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.22 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
406 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.22 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
370 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  26.22 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0662  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0132894  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  28.35 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
409 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  34.78 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.5 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  24.43 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>