More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1385 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  100 
 
 
346 aa  702    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  46.09 
 
 
347 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  46.96 
 
 
347 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  48.16 
 
 
350 aa  292  5e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  46.09 
 
 
347 aa  291  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  40.62 
 
 
358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.43 
 
 
352 aa  237  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  36.65 
 
 
358 aa  230  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  38.76 
 
 
359 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  39.04 
 
 
358 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  38.2 
 
 
359 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  38.14 
 
 
354 aa  225  8e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
374 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  27.61 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
371 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
364 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
396 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
355 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  23.71 
 
 
384 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  21.47 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
383 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  21.07 
 
 
419 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
365 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2882  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
364 aa  86.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
409 aa  85.9  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 
355 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
356 aa  84  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0200  putative glycosyl transferase, group 1  21.02 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  23.64 
 
 
385 aa  82  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 
361 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 
364 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.99 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
387 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  20.95 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  31.32 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
398 aa  79.3  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
351 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  27.4 
 
 
366 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2134  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  22.77 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  22.29 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  21.86 
 
 
386 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  22.44 
 
 
428 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  23.53 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
375 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  22.85 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  21.16 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0292  glycosyltransferase  27.16 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000491136  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.51 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  25.99 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  20.21 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2433  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.51 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.04 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  27.3 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.58 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.51 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  33.58 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.58 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.4 
 
 
498 aa  69.3  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 
762 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>