More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0740 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
368 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  60.57 
 
 
364 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  40.62 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1512  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 
394 aa  164  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.177652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
365 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  37.87 
 
 
385 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
660 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.36 
 
 
375 aa  155  1e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
374 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
361 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  29.64 
 
 
358 aa  151  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  33.24 
 
 
388 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  32.75 
 
 
440 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  34.22 
 
 
394 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  30.66 
 
 
355 aa  149  7e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  31.73 
 
 
371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
396 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 
353 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  34.63 
 
 
416 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 
409 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 
364 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
669 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  38.71 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
383 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
678 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 
371 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  36.12 
 
 
435 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  44.52 
 
 
369 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
368 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 
762 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
356 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
890 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  40.93 
 
 
443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  32.21 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  26.51 
 
 
368 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.5 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.5 
 
 
392 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.03 
 
 
420 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.5 
 
 
420 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.5 
 
 
420 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.5 
 
 
420 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.5 
 
 
420 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  24.79 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  29.41 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  42.21 
 
 
376 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
808 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  25.07 
 
 
359 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  25 
 
 
365 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  24.02 
 
 
354 aa  112  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  25.21 
 
 
359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  42.17 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 
362 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  24.23 
 
 
358 aa  109  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  34.4 
 
 
393 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
353 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25651  putative glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
404 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.28 
 
 
381 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
370 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  31.52 
 
 
419 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  26.36 
 
 
347 aa  103  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.4 
 
 
415 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  41.73 
 
 
346 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  41.51 
 
 
375 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  23.98 
 
 
363 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 
381 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  45 
 
 
379 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
392 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.73 
 
 
419 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  28.3 
 
 
350 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 
375 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
1264 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.3 
 
 
366 aa  99.8  7e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  31.97 
 
 
428 aa  99.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  38.07 
 
 
750 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  29.75 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  24.3 
 
 
378 aa  99.4  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 
384 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25 
 
 
366 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
371 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  26.13 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
364 aa  96.3  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  34.8 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  32.83 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
425 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 
390 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  23.08 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  39.26 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.29 
 
 
386 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>