More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13028 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  100 
 
 
365 aa  717    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  35.46 
 
 
375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 
390 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
371 aa  199  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
361 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
376 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.42 
 
 
369 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
393 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  32.5 
 
 
375 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  33.23 
 
 
368 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
348 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
374 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.74 
 
 
386 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
309 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  30.77 
 
 
379 aa  132  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.61 
 
 
372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 
368 aa  126  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.08 
 
 
374 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  29.6 
 
 
365 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 
381 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
361 aa  122  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.8 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  29.07 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  29.07 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.68 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.29 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  29.21 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
359 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
364 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
399 aa  113  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
370 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 
375 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 
376 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
374 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 
356 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
356 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 
390 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
365 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  30.13 
 
 
393 aa  106  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  36.78 
 
 
368 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
418 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
346 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  33.95 
 
 
321 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
363 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
420 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
420 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
420 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
420 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
392 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
420 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
392 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.32 
 
 
498 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  26.44 
 
 
419 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.21 
 
 
415 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.78 
 
 
367 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.03 
 
 
465 aa  99.4  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
1032 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
357 aa  96.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
419 aa  96.7  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  34.3 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.27 
 
 
372 aa  96.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  32.28 
 
 
385 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.66 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
390 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.81 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  22.37 
 
 
386 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 
420 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
419 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 
394 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.72 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
372 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  24.13 
 
 
385 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
370 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  25.77 
 
 
430 aa  89.4  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.77 
 
 
427 aa  89.7  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
436 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 
364 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  26.73 
 
 
386 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.19 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>