More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1409 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
356 aa  720    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
376 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
365 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  28.66 
 
 
369 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
390 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
361 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  38.71 
 
 
365 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 
364 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
375 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  38.71 
 
 
365 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  38.71 
 
 
365 aa  100  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
375 aa  99.4  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
370 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
365 aa  93.6  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
386 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
368 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
371 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
353 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
309 aa  91.3  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
348 aa  89.7  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
409 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 
498 aa  89.4  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 
361 aa  89.7  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.27 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
374 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 
465 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  26.96 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.85 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  24.9 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.9 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  20.88 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  24.84 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  31.79 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  24.84 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
388 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 
669 aa  79.3  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.95 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  25.47 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.88 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.87 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1386  general glycosylation pathway protein  28.87 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
678 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.18 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.71 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.7 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
401 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  34.27 
 
 
386 aa  76.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.11 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  25.49 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  22.99 
 
 
384 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  24.86 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  23.42 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  25.79 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  22.4 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  31.29 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00660  glycosyltransferase  24.53 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0958  general glycosylation pathway protein  25.64 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  27.5 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  21.92 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 
420 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  27.19 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
750 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.2 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3566  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.67 
 
 
392 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  30.46 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  24.45 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.37 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
390 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13941  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.164245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>