More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0588 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 377 aa  752    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.31 
 
 		 465 aa  156  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.46 
 
 		 498 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.43 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3397  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3394  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 392 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3396  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3395  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  25.42 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  27.35 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.29 
 
 		 372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 		 396 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.42 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 375 aa  113  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  26 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  27.68 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 		 374 aa  99.8  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  27.89 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  30 
 
 		 419 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  27.4 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 419 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 348 aa  97.1  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  34.55 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5027  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 856 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  20.53 
 
 		 375 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 420 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.12 
 
 		 374 aa  92.8  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.5 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.57 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0454  nitric oxide reductase large subunit  28.02 
 
 		 347 aa  89.7  6e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0224888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 374 aa  89.7  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 346 aa  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 		 346 aa  89.7  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  24.45 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 350 aa  89.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 		 370 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 374 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.45 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 411 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  29.63 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.97 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  22.82 
 
 		 393 aa  86.3  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.28 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  22.29 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.93 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.03 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.03 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  20.27 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5390  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.03 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 750 aa  82.8  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.33 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 361 aa  82.8  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  25.93 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  23.57 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.34 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.77 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.77 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.77 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  24.86 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.95 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.78 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.49 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.14 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase, putative  32.05 
 
 		 1098 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.048897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  32.06 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>