More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0755 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 420 aa  848    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.52 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.52 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.52 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.28 
 
 		 420 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.04 
 
 		 420 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.23 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  45.98 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.31 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  40.92 
 
 		 419 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  42 
 
 		 419 aa  269  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.83 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 		 371 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  38.07 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 374 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.75 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  49.1 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.04 
 
 		 465 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  39.62 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  43.37 
 
 		 346 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.05 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 		 309 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 		 374 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  41.49 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  44.97 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 396 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  36.67 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  44.64 
 
 		 361 aa  117  5e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  41.09 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  31.16 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.02 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  37.25 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  37.02 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.1 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.97 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.77 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  37.57 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  36.46 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 		 1032 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  37.73 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  41.98 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 364 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  42.21 
 
 		 359 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  40.91 
 
 		 399 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  40.36 
 
 		 366 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  40.4 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 660 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  39.07 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  37.34 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.08 
 
 		 374 aa  104  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 356 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 356 aa  103  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 		 364 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  41.96 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  38.32 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 		 890 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.89 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.33 
 
 		 356 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 361 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 361 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  38.27 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  38.27 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  39.73 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 762 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 346 aa  96.3  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  37.3 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  37.79 
 
 		 361 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 393 aa  94  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  34.21 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 		 425 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  32.62 
 
 		 346 aa  93.6  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 365 aa  93.2  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  37.14 
 
 		 419 aa  93.2  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 361 aa  93.2  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  30.29 
 
 		 374 aa  93.2  9e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  40.58 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  31.56 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  36.07 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 		 387 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>