More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1376 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 368 aa  752    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  40.06 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.64 
 
 		 369 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 390 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.3 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 375 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  41.49 
 
 		 420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.36 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  40.59 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  37.62 
 
 		 419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 		 361 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  42.96 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.51 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.11 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  31.85 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.35 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  35.96 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  36.99 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.17 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.55 
 
 		 465 aa  103  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  29.2 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 		 386 aa  99.4  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0388  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  38.15 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  41.06 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 		 425 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 361 aa  96.7  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  27.37 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.19 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.77 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  35.38 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.04 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 		 353 aa  92.8  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.32 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 1032 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 		 393 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  25.63 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.01 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  27.92 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  27.53 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  30.62 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1472  glycosyl transferase  28.96 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.805759  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 364 aa  89.7  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  32.49 
 
 		 398 aa  89.7  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 		 356 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  25.64 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.11 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5440  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.09 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  39.39 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.72 
 
 		 498 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  31.88 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>