More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3984 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  98.03 
 
 		 356 aa  728    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  92.7 
 
 		 356 aa  695    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  93.26 
 
 		 356 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  92.42 
 
 		 356 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  99.15 
 
 		 356 aa  735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 356 aa  741    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  98.59 
 
 		 356 aa  730    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  72.68 
 
 		 358 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  46.94 
 
 		 361 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  46.94 
 
 		 361 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  46.39 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.11 
 
 		 361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  45 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  44.72 
 
 		 361 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  44.72 
 
 		 361 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  44.6 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.45 
 
 		 365 aa  291  9e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  43.89 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  28.77 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 357 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  37.56 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 384 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  27.84 
 
 		 369 aa  122  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  41.11 
 
 		 390 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  36.22 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  36.42 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 		 371 aa  113  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.47 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  35.42 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.38 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 375 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.22 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  34.5 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 361 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  34.5 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  34.5 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  31.07 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  26.06 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.78 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.25 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  23.55 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.25 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.25 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.53 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.53 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.53 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.53 
 
 		 420 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.8 
 
 		 373 aa  90.1  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 419 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 386 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  32.93 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  28.14 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 		 375 aa  79.3  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 1032 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.61 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 660 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.83 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  35.34 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3103  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0778318  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 739 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  33.57 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.49 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  27.27 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  28.25 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2217  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  33.64 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  31.43 
 
 		 496 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  27.27 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  31.43 
 
 		 496 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  33.64 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  30.11 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.74 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 		 750 aa  69.3  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>