More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3918 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3999  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  98.61 
 
 
359 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.201364  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4106  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  98.61 
 
 
359 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  98.33 
 
 
359 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  100 
 
 
363 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  98.61 
 
 
359 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  64.07 
 
 
359 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
356 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1370  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  33.52 
 
 
349 aa  187  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
381 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
376 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.5 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  29.38 
 
 
385 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.88 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
361 aa  87  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
361 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
361 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.2 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
392 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
384 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  28.99 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  30.77 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
371 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
419 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  29.34 
 
 
379 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1209  putative glycosyltransferase  37.82 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.05 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  26.05 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.98 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  30.06 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  27.49 
 
 
745 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.43 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  23.75 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.18 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0217  glycosyltransferase  25.27 
 
 
365 aa  75.1  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  31.97 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.24 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.42 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
660 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
890 aa  72.8  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 
365 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  30.17 
 
 
496 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  30.17 
 
 
496 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.37 
 
 
501 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 
409 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  26.19 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
309 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  30.37 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.89 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  25.2 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  26.76 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>