More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2054 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 496 aa  1015    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  49.7 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  29.33 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  29.33 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.82 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.48 
 
 		 496 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.48 
 
 		 496 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  23.23 
 
 		 743 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  32.78 
 
 		 500 aa  100  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0565  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 381 aa  93.6  6e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0010  glycosyltransferase  25.54 
 
 		 541 aa  92  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  21.07 
 
 		 513 aa  91.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 		 660 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 		 396 aa  90.5  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 363 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 388 aa  88.6  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 		 374 aa  87  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  29.53 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.04 
 
 		 502 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  25.52 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 890 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  26.34 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  29.02 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2591  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.97646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 669 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  24.47 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.45 
 
 		 420 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.12 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3918  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  30.43 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0109965 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.12 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  21.05 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4679  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3937  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  30.43 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4106  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  30.43 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.248516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 678 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 353 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3999  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  30.43 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.201364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4044  UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1, 6-D-galactosyltransferase  30.43 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.169021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.18 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  26.62 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  28.57 
 
 		 419 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 383 aa  73.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  27.33 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  27.7 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 356 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1301  glycosyltransferase  24.75 
 
 		 548 aa  72  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1300  glycosyltransferase  20.68 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 		 384 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0077  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2824  glycosyl transferase group 1  35.35 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3431  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  23.31 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 371 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1923  glycosyltransferase  30.29 
 
 		 481 aa  69.7  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3275  glycosyl transferase group 1  44.29 
 
 		 352 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>