More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2275 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2728  hypothetical protein  63.15 
 
 		 502 aa  698    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 502 aa  1039    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2672  hypothetical protein  63.15 
 
 		 502 aa  698    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  54.6 
 
 		 503 aa  573  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  50.6 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1923  glycosyltransferase  26.41 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1301  glycosyltransferase  24.16 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0010  glycosyltransferase  27.39 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  23.5 
 
 		 500 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.95 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  24.95 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.05 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  21.31 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.05 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.37 
 
 		 500 aa  97.8  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 808 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.04 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 678 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 394 aa  77  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 669 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 		 386 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.97 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1956  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1300  glycosyltransferase  24.16 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1267  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0583334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  25.9 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.8 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.28 
 
 		 501 aa  67  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1589  glycosyltransferase  26.04 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.679679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  24.52 
 
 		 385 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 377 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  25.13 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  25.65 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0081  hypothetical protein  27.61 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.84 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 		 660 aa  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.55 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  25.9 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  28.79 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0616  putative glycosyltransferase protein  26.94 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  29.03 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  28.27 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 422 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1643  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 359 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 		 890 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  25 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  23.45 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  32 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  21.05 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0846  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1085  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  22.94 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  28.4 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  23.12 
 
 		 382 aa  57  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  25.64 
 
 		 347 aa  57  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>