More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0081 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0081  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  1033    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1300  glycosyltransferase  30.99 
 
 
506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  30.04 
 
 
513 aa  234  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  26.64 
 
 
490 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  26.64 
 
 
490 aa  189  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1301  glycosyltransferase  26.01 
 
 
548 aa  188  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0010  glycosyltransferase  26.54 
 
 
541 aa  187  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0011  glycosyltransferase  26.73 
 
 
490 aa  180  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.39 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.6 
 
 
496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.6 
 
 
496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  27.78 
 
 
500 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 
388 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
890 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  22.03 
 
 
743 aa  93.6  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.72 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  28.5 
 
 
385 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
364 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
390 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  30.48 
 
 
390 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.92 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
660 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  32.58 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  26.32 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  22.46 
 
 
503 aa  80.1  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.68 
 
 
386 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
389 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
678 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 
361 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
396 aa  78.2  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  22.81 
 
 
669 aa  78.2  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
394 aa  77  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  25.63 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  32.64 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  24.28 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  26.44 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 
383 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1923  glycosyltransferase  22.8 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 
382 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
380 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
363 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.19 
 
 
501 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
762 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 
374 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
370 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.43 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2493  glycosyl transferase, group 1  24.23 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0575411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.9 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
419 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  29.65 
 
 
353 aa  69.7  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.19 
 
 
382 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  26.01 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0455  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.32 
 
 
352 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.307321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3405  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 
379 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  22.47 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.71 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
808 aa  67.8  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
414 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  26.88 
 
 
346 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.89 
 
 
496 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 
502 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 
420 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2672  hypothetical protein  27.54 
 
 
502 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2728  hypothetical protein  27.54 
 
 
502 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12393  Glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
336 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>