More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1256 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1036    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  27.53 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0010  glycosyltransferase  25.48 
 
 		 541 aa  166  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.29 
 
 		 496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.29 
 
 		 496 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.6 
 
 		 500 aa  159  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.63 
 
 		 490 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  23.63 
 
 		 490 aa  156  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0081  hypothetical protein  27.78 
 
 		 500 aa  153  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1301  glycosyltransferase  23.58 
 
 		 548 aa  154  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1300  glycosyltransferase  25.94 
 
 		 506 aa  150  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2275  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.5 
 
 		 502 aa  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0011  glycosyltransferase  22.53 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.53 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 388 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1448  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.76 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.622489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0452  glycosyltransferase, putative teichoic acid biosynthesis protein  24.49 
 
 		 503 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 		 669 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2054  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.78 
 
 		 496 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  20.6 
 
 		 743 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 383 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 396 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2672  hypothetical protein  25.81 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2728  hypothetical protein  25.81 
 
 		 502 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 678 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2591  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 478 aa  94.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.97646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 443 aa  94  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.03 
 
 		 501 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 368 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2898  Glycosyltransferase-like protein  27.72 
 
 		 435 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  26.09 
 
 		 416 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 386 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 374 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 660 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  25.82 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.62 
 
 		 375 aa  86.7  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 		 363 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05930  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.289999  hitchhiker  0.000000027455 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0542  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 808 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2243  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0584  putative glycosyltransferase  25.91 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.914213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  28.25 
 
 		 440 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 353 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0179  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.37 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.98 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.98 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.98 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.98 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.84 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 388 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 361 aa  79.7  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9135  putative glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.780016  normal  0.822205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.09 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1085  glycosyl transferase, group 1  23.63 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 350 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  31.3 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1211  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.444439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 762 aa  73.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4018  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  27.17 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1923  glycosyltransferase  24.3 
 
 		 481 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.78 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1215  imidazoleglycerol phosphate dehydratase  25.93 
 
 		 347 aa  72  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  25.82 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  32.48 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>